Κατά τη δεύτερη επίσκεψη, έχοντας ήδη τα αποτελέσματα των εξετάσεων, διευκρινίζεται η αιτία του προβλήματος. Εάν κριθεί απαραίτητη η περαιτέρω διερεύνηση της/του συζύγου, αυτό γίνεται με τη μέθοδο της διαγνωστικής υστεροσκόλησης και λαπαροσκόπησης, ώστε να μελετηθεί η φυσιολογική ανατομία της πυέλου και του εσωτερικού της μήτρας.

Τα αίτια της γυναικείας υπογονιμότητας μπορεί να έχουν να κάνουν με την ωορρηξία (39% των περιπτώσεων), την καταστροφή των σαλπίγγων (30%), προβλήματα τραχήλου - συνουσίας (18%) και ενδομητρίωση (13%)

Αιτίες της ανδρικής υπογονιμότητας είναι η κιρσοκήλη (σε ποσοστό 35%), φλεγμονές και άλλα προβλήματα (23%), η ιδιοπαθής άγνωστη αιτιολογία (20%), η απόφραξη (14%) και η συμβολή του γυναικείου παράγοντα (8%).